FG Kowarik

Neurologische B-Zell Immunologie

Die Forschungsgruppe „Neurologische B-Zell Immunologie“ beschäftigt sich primär mit der Rolle von B-Zellen bei neuro-inflammatorischen Erkrankungen des Zentralnervensystems (ZNS) wie der Multiplen Sklerose und Neuromyelitis-optica-Spektrum-Erkrankung (NMOSD). Während bei der NMOSD die Produktion von pathologisch relevanten Antikörpern gegen Aquaporin-4 Wasserkanäle eindeutig nachgewiesen werden konnte, ist die Rolle von B Zellen bei der Multiplen Sklerose aktuell noch nicht hinreichend verstanden. Durch den erfolgreichen Einsatz von B-Zell depletierenden Therapien in der Multiplen Sklerose konnte ein relevanter Einfluss von B-Zellen in der Pathogenese jedoch klar belegt werden. Ziel der Arbeitsgruppe ist es, die Rolle von B Zellen bei der Multiplen Sklerose als auch bei anderen Autoimmunerkrankungen im Detail zu verstehen. In einem interdisziplinären Ansatz wird auch untersucht, ob und in welcher Funktion B Zellen bei primär nicht-inflammatorischen Erkrankungen (z.B. Schlaganfällen, zerebrale Tumore u.a.) pathophysiologisch relevant sind.

Methodik
Mitarbeitende
Publikationen
Partner und Kooperationen


Immunglobulin Repertoire Analyse auf Transkriptom Ebene

 

Mittels „next-generation“ Massensequenzierung können umfangreich Immunglobulin (Ig) Sequenzen auf Transkriptom Ebene erfasst werden. Durch bioinformatische Ansätze werden diese Immunglobulin Repertoire weiter bearbeitet und in Bezug auf z.B. Ig Subklassen, Diversität und Klonalität untersucht. Des Weiteren können Reifungsbäume erstellt werden, anhand derer auch Migrationsprozesse von B Zellen nachzuverfolgen sind.

Beispiel für einen B-Zell Reifungsbaum, bei dem eine Liquor B Zelle (blau) in direktem Bezug zu einem peripheren B Zell Cluster (rote Punkte) steht und mutmaßlich direkt von einer B Zelle im peripheren Blut abstammt. Migrationsprozesse von B Zellen zwischen z.B. Blut- und Liquor-Kompartiment können hierdurch im Detail untersucht werden.

 

Immunglobulin Repertoire Analyse auf Proteom Ebene 

 

Die Immunglobulin (Ig) Fraktion wird in dieser Analyse von anderen (Serum-)Proteinen separiert, in kleine Peptid-Fragmente zerlegt und anschließend mittels Massen-Spektroskopie analysiert. Die daraus resultierenden Ig Peptid Fragmente können dann mit den Ig Transkriptom Repertoiren in spezifischen Bereichen überlappt werden, um die Dynamik zwischen B Zell Reifung und anschließender Antikörperproduktion im Detail zu untersuchen.  

Überlappung zwischen Ig Transkriptom und Ig Proteom: Immunglobulin Peptide (gelb unterlegt) werden mit Ig Transkriptom Repertoiren abgeglichen und hinsichtlich Spezifität (Mutationen zur Keimbahn-Sequenz, grün markiert) untersucht. Hierdurch kann differenziert werden, in welchem Umfang zirkulierende B Zellen zur tatsächlichen Antikörperproduktion beitragen.

 

Einzelzell Analyse von B Zellen

 

Durch die Einzelzell Analyse von B Zellen können die leichte als auch schwere Immunglogulinen Kette von einzelnen B Zellen erfasst und anschließend in einem aufwändigen Verfahren rekombinante Antikörper hergestellt werden. Diese Antikörper können zum einen hinsichtlich ihres Target-Antigens untersucht werden und zudem funktionelle Aspekte erfasst werden.


 
Name
Arbeitsgruppe
Telefon
E-Mail
 Lena Beller
Lena Beller
B-Cell-Immunology
 
PD Dr. Markus Kowarik
PD Dr. Markus Kowarik Research Group Leader
B-Cell-Immunology

07071
29-87529

 
 Markus Krumbholz
Markus Krumbholz
B-Cell-Immunology
 
 Antonia Lang
Antonia Lang Bachelor Student
B-Cell-Immunology

+49 (0)7071-
29-81956

 
 Shilan Nourani Koliji
Shilan Nourani Koliji Master Student
B-Cell-Immunology

+49-(0)7071-
29-81956

 
 Natalie Rumpel
Natalie Rumpel Study Nurse
B-Cell-Immunology

07071
86703

 
Dr. Christoph Ruschil
Dr. Christoph Ruschil Physician
B-Cell-Immunology

07071
29 61893

 
 Sonja Schembecker
Sonja Schembecker PhD Student
B-Cell-Immunology

+49 (0)7071-
29-88885

 
 Alessia Semplice
Alessia Semplice Study Assistant
B-Cell-Immunology

+49 (0)7071-
29-80707

 
 Nicole Vasilenko
Nicole Vasilenko PhD Student
B-Cell-Immunology

+49(0)7071/
2988886

 


Ruschil C
, Kemmerer CL, Beller L, Gabernet G, Kowarik MC. Next Generation Sequencing of Cerebrospinal Fluid B Cell Repertoires in Multiple Sclerosis and Other Neuro-Inflammatory Diseases-A Comprehensive Review. Diagnostics (Basel). 2021 Oct 11;11(10):1871.

Kemmerer CL, Schittenhelm J, Dubois E,Neumann L, Häsler LM, Lambert M, Renovanz M, Kaeser SA, Tabatabai G, Ziemann U, Naumann U, Kowarik MC. Cerebrospinal fluid cytokine levels are associated with macrophage infiltration into tumor tissues of glioma patients. BMC Cancer. 2021 Oct 15;21(1):1108.

Ruschil C, Gabernet G, Lepennetier G, Heumos S, Kaminski M, Hracsko Z, Irmler M, Beckers J, Ziemann U, Nahnsen S, Owens GP, Bennett JL, Hemmer B, Kowarik MC. Specific Induction of Double Negative B Cells During Protective and Pathogenic Immune Responses. Front Immunol. 2020 Dec 18;11:606338.

Kowarik MC, Astling D, Lepennetier G, Ritchie A, Hemmer B, Owens GP, Bennett JL. Differential Effects of Fingolimod and Natalizumab on B Cell Repertoires in Multiple Sclerosis Patients. Neurotherapeutics. 2020 Nov 30. Epub ahead of print.

Kemmerer CL, Pernpeintner V, Ruschil C, Abdelhak A, Scholl M, Ziemann U, Krumbholz M, Hemmer B, Kowarik MC. Differential effects of disease modifying drugs on peripheral blood B cell subsets: A cross sectional study in multiple sclerosis patients treated with interferon-β, glatiramer acetate, dimethyl fumarate, fingolimod or natalizumab. PLoS One. 2020 Jul 27;15(7):e0235449.

Lepennetier G, Hracsko Z, Unger M, Van Griensven M, Grummel V, Krumbholz M, Berthele A, Hemmer B, Kowarik MC. Cytokine and immune cell profiling in the cerebrospinal fluid of patients with neuro-inflammatory diseases. J Neuroinflammation. 2019, 16(1):219.

Kowarik MC, Astling D, Gasperi C, Wemlinger S, Schumann H, Dzieciatkowska Monika, Ritchie AM, Hemmer B, Owens GP, Bennett JL. CNS Aquaporin-4 specific B cells connect with multiple B cell compartments in neuromyelitis optica spectrum disorder. Ann Clin Transl Neurol. 2017, 4(6):369-380. 

Kowarik MC, Dzieciatkowska M, Wemlinger S, Ritchie AM, Hemmer B, Owens GP, Bennett JL. The cerebrospinal fluid immunoglobulin transcriptome and proteome in neuromyelitis optica reveals central nervous system-specific B cell populations. Journal of Neuroinflammation. 2015, 12:19.

Kowarik MC, Soltys J, Bennett JL.The treatment of neuromyelitis optica. Journal of neuro-ophthalmology. 2014, 34(1):70-82.

Kowarik MC, V Grummel, S Wemlinger, D Buck, M S Weber, A Berthele, B Hemmer. Immune cell subtyping in the cerebrospinal fluid of patients with neurological diseases. Journal of Neurology. 2013, 261(1):130-43.

Kowarik MC, Cepok S, Sellner J, Grummel V, Weber MS, Korn T, Berthele A, Hemmer B. CXCL13 is the major chemokine for B cell recruitment and B cell response in the CSF during neuroinflammation. Journal of Neuroinflammation. 2012, 9:93.

Kowarik MC, Einhäuser J, Jochim J, et al. Impact of the COMT Val108/158Met polymorphism on the mu-opioid receptor system in the human brain: mu-opioid receptor, met-enkephalin and beta-endorphin expression. Neuroscience letters. 2012, 506(2):214-9. 

Kowarik MC, Pellkofer HL, Cepok S, Korn T, Kümpfel T, Buck D, Hohlfeld R, Berthele A, Hemmer B. Differential effects of fingolimod (FTY720) therapy on immune cells in the cerebrospinal fluid and blood of multiple sclerosis patients. Neurology. 2011, 76(14):1214-21.

Kowarik M, Onofri C, Colaco T, Stalla GK, Renner U. Platelet-derived growth factor (PDGF) and PDGF receptor expression and function in folliculostellate pituitary cells. Exp Clin Endocrinol Diabetes. 2009, 118(2):113-20.


Die Projekte finden in enger Kooperation mit Herrn PD Dr. M. Krumbholz und Mitarbeitern statt.

Prof. U. Naumann: Molekulare Neuro-Onkologie Hertie Institut für klinische Hirnforschung

Dr. S. Nahnsen: Zentrum für Quantitative Biologie (QBiC)

Dr. S Autenrieth: Flow Cytometry Core Facility, Universitätsklinikum Tübingen

Dr. N. Casadei: Sequencing Core facility, Universitätsklinikum Tübingen

 

Internationale Kooperation:

Jeffrey Bennett und Greg Owens, Department of Neurology, University of Colorado, USA 

Leitung Forschungsgruppe
apl. Prof. Dr. Markus Kowarikmarkus.kowarik@med.uni-tuebingen.deAnschrift

Hertie-Zentrum für Neurologie

Hertie-Institut für klinische Hirnforschung

Abteilung Neurologie mit Schwerpunkt neurovaskuläre Erkrankungen

Hoppe-Seyler-Straße 3
72076 Tübingen

Tel.: +49 (0)7071 29-68298
Fax: +49 (0)7071 29-25155

Forschungsgruppen